天主教于明末清初传入云南 ,1696 年设立云南教区， 1755 年云南教区撤销。1840年云南教区重新成立，1843 年，在盐津县的龙溪、成凤山、田坝头、叭耳岩等四地首先建立教堂，并设“主教公署”，第一任主教为法国人袁若瑟（1843年）。1885 年，第二任主教古若望将“主教公署”迁至昆明，在平政街设立了主教座堂。1885年至1900年的15年间，云南天主教以昆明为中心，共有13个县、辖有昆明、盐津、会泽、昭通、彝良、永胜、洱源、邓川、漾濞、华坪、砚山、弥勒、通海，共有教堂13所。

　　 1946年4月11日教宗庇护十二世颁布“成立中国教会圣统制诏书”通令中国建立“圣统制”，将中国教会划分为20个教省， 在云南教省设立昆明总主教区、大理教区和昭通教区，昆明总主教区为中国20个总主教区之一。德为能（巴黎外方传教会传教士，法国人）为天主教昆明总主教区第一任主教，任至 1952 年。新中国成立后，1958 年孔令忠被祝圣为天主教昆明总主教区第二任主教；2006年4月30日马英林祝圣为天主教昆明总教区第三任主教。

　　目前，天主教昆明总主教区辖管：昆明、红河、曲靖，文山、玉溪、楚雄、版纳7个州市,设天主教堂26座，有部分教堂正在修建中。教友4万余人, 神父10位、修女10位，分别有汉族、彝族、苗族、壮族等4个民族中的部分公民信仰。